在《第二银河》的科研系统中，六大模块——舰船、武器、工程、电子、生产、指挥——各司其职，构成了宇宙探索的宏大蓝图。其中，舰船核心系统尤为关键，建议玩家优先将处理器和反应堆升级至T2级别。至于船体改造，暂无需急于提升，因为改造后的船体仅能增强航船的黄色生命值。然而，这黄色生命值却无法提供护盾保护，意味着所有来自敌人的攻击都将直接造成真实伤害。而且，黄色生命值的承受能力远不及蓝色护盾的十分之一，因此，当航船的护盾即将消失时，也就预示着航船即将面临崩溃的命运。

　　接下来是能量系统基础和能量系统进阶，这两个科技是第二顺位的最佳选择。升级之后能够增加舰船的能量，能够给航船回复额外百分之十三点五的能量。除了能量的投射之外，其他的五个科技也都非常有用，若玩家喜欢玩pvp模式，那么在能量系统的科技上，就一定要及时升级，要不然在5-6阶段的虫洞扭曲干扰里会让玩家迅速没电。